Sous le sol du bâtiment actuel; au niveau de la croisée du transept, ont été relevés les vestiges de cinq élévations successives de l'abside, la plus ancienne semblant dater de la fin du IVe siècle. À l'origine, Saint-Jean faisait partie d'un groupe épiscopal avec deux autres édifices situés au Nord : un baptistère transformé en une église qui prit le vocable de Saint-Étienne et fut détruite à la Révolution française et une autre église (Sainte-Croix), qui servit d'église paroissiale au Moyen Âge et fut elle aussi victime de la tourmente révolutionnaire. La juxtaposition de ces trois édifices, entourés d'une enceinte fortifiée, peut être attestée dès le IVe siècle pour le baptistère, la seconde moitié du IVe siècle pour Saint-Jean et le VIIe ou le VIIIe siècle pour Sainte-Croix. On sait par ailleurs que l'archevêque Leidrade restaura Saint-Jean et Saint-Étienne au début du IXe siècle.
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seau à eau bénite (bénitier portatif)
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élément de bras de siège (?) : Griffon
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chandelier
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aiguière
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reliquaire
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châsse
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crosse pastorale (crosse épiscopale)
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crosse pastorale (crosse épiscopale)
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croix de procession
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croix de procession
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reliure : plat de livre liturgique (psautier)
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2 reliures d'un psautier : Le Calvaire, Le Christ juge
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3 pyxides
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gémellions
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mors de chape
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crosse pastorale dite de saint François de Sales
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crosse pastorale
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crosse pastorale (crosse abbatiale)
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croix de procession
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croix de procession
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calice
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ostensoir
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pale (corporalier)
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mitre
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mitre : Saint Pierre, Saint Paul, Vierge à l'Enfant, La Fuite en Egypte, La Résurrection
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statue : Saint Etienne
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statue : Saint Jean-Baptiste
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banc de choeur : banc curial à trois places
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cloche (bourdon) dite la grosse Marie
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peigne liturgique
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diptyque commémoratif : Le Couronnement de la Vierge, L'Ascension
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diptyque commémoratif : L'Adoration des Mages
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baiser de paix : Le Calvaire
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baiser de paix : La Vierge entre deux saints
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châsse
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navette à encens
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ciboire (pyxide)
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crosse pastorale (crosse épiscopale)
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autel portatif
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2 encensoirs style gothique
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calice
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calice
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calice
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calice
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calice
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calice
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croix de procession en souvenir du concile de Lyon de 1274
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croix de procession en souvenir du concile de Lyon de 1274
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reliquaire-monstrance en forme de pyxide
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baiser de paix : La Nativité
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croix de bénédiction
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porte de tabernacle : L'Ascension
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tableau : Le Christ entre la Vierge et saint Jean
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étole
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chasuble dite de saint Vincent de Paul
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pièce murale (verdure)
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pièce murale : Bergerie
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pièce murale : Sujet mythologique
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pièce murale : Scène de chasse
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pièce murale : Verdure à volatiles
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pièce murale : Scène de festin
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pièce murale : Le Couronnement d'une reine
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pièce murale : Une Licorne et un cerf
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pièce murale : La Soumission de Darius à Alexandre
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pièce murale : Le Triomphe d'Alexandre
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ensemble de 5 pièces murales : tenture de l'histoire de Jacob
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antependium
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manuscrit : obituaire
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tableau : Le Mariage mystique de sainte Catherine
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tableau : La Descente du Saint-Esprit sur les apôtres
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tableau : La Circoncision
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tableau : Le Christ et la Cananéenne
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tableau : La Présentation au temple
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tableau : Saint Louis recevant la couronne d'épines
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bas-relief : La Vierge
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6 chandeliers (candélabres)
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2 éléments d'architecture
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4 chapiteaux
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26 chaises style Empire
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croix : Le Calvaire
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3 chaises style Empire
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tableau : Le Martyre de saint Hippolyte
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triptyque : La Vierge à l'Enfant entourée d'anges
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manuscrit : missel de Thomas James, évêque de Dol
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manuscrit : missel dit du pape Boniface VIII
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manuscrit : missel
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manuscrit : livre d'heures
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manuscrit : missel
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manuscrit : livre d'heures
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2 manuscrits : Traités de droit canon
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manuscrit : pontifical romain
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manuscrit : missel de l'église Saint-Paul de Lyon
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manuscrit : pontifical
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manuscrit : Les Offices de la Vierge
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manuscrit : évangéliaire à l'usage d'un abbé de l'église de Lyon
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manuscrit : La Vie de Jésus-Christ
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statue : Vierge à l'Enfant
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tableau : La Visitation, cadre
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tableau : Le Baptême du Christ
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pièce murale
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tableau : Saint François de Paule marchant sur les eaux, cadre
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tableau : Saint Vincent de Paul prêchant la charité
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tableau : Saint Sébastien
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tableau : Le Ravissement de saint Joseph
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tableau : Portrait d'un pape
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tableau : Saint Polycarpe conduit au bûcher
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tableau : L'Adoration des Mages, cadre
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tableau (may des orfèvres) : Le Martyre de saint Barthélémy et de saint Gervais
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tableau : L'Incrédulité de saint Thomas
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tableau : Saint Pothin apportant en Gaule l'image de la Vierge
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tableau : Saint Irénée choisissant le supplice de la Croix
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tableau : Saint Dominique recevant le Rosaire
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tableau : Portrait du cardinal de Bouillon, cadre
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tableau : Portrait de Monseigneur de Pins, cadre
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tableau : Portrait du cardinal de Marquemont, cadre
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tableau : Portrait du cardinal Guérin de Tencin, cadre
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reliquaire de la Vraie Croix
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reliquaire-monstrance de sainte Thérèse d'Avila
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reliquaire de la Vraie Croix du cardinal de Bonald
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reliquaire-monstrance de saint Irénée
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croix de procession du cardinal Fesch
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ciboire
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calice
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calice et patène du cardinal Fesch
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calice
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ostensoir transformé en reliquaire de sainte Agathe
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burettes et plateau du cardinal Fesch
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aiguière et bassin à ablutions de Monseigneur de Pins
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aiguière
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crosse pastorale du cardinal Fesch
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tabatière avec miniature : Le Cardinal Fesch
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stalle de célébrant (stalle épiscopale)
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plaque funéraire de cinq chapelains
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plaque funéraire de Jean de Gueti
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tableau : L'Adoration du Sacré-Coeur
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tableau : Sainte Cécile morte, cadre
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tableau : Les Pèlerins d'Emmaüs
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tableau : Saint Sébastien soigné par les saintes femmes
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tableau : Le Ravissement de saint Vincent de Paul, cadre
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tableau : La Présentation au temple
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horloge astronomique
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clôture de choeur (grilles)
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coffret
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chasuble
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pièce murale : Esaü vendant son droit d'aînesse à Jacob
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pièce murale : Isaac bénissant Jacob
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pièce murale : Le Songe de Jacob
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pièce murale : La Rencontre de Jacob et Rachel
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pièce murale : La Fuite de Jacob avec ses deux femmes
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crosse pastorale
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patène
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patène
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aiguière
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plateau aux armes du cardinal de Bonald
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patène
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croix pectorale reliquaire du cardinal Fesch
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ostensoir
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fibule
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retable et son tableau : Saint Joseph
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retable et son tableau : Baptême du Christ
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calice
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ciboire
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calice des douze apôtres
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aiguière et son bassin à ablutions
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buste : Pie VII
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tombeau du cardinal de Bourbon
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reliquaire
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reliquaire du coeur de saint Vincent de Paul
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deux reliefs (plaques de reliure) : Nativité et Crucifixion
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pendentif (porte-hostie)
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croix : Scènes de la vie du Christ
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sandales liturgiques de Léon XIII (mules du pape)
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chapelle de messe : calice, patène, burettes et leur plateau
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ciboire
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ostensoir
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formal n°1
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formal n°2
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statue : Christ en croix
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statue : Vierge de l'Immaculée Conception
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garniture d'autel : deux chandeliers
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deux aubes
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ornement noir : chasuble, manipule et voile de calice
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orgue de tribune
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orgue de tribune : partie instrumentale de l’orgue
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orgue de tribune : buffet d’orgue
